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Borrelli, Virginia Maria Grazia. "LIPOXYGENASE 4 CHARACTERIZATION AND CRISPR-CAS9 APPROACH TO ENHANCE FUSARIUM VERTICILLIOIDES (FV) RESISTANCE IN ZEA MAYS", Università Cattolica del Sacro Cuore, XXX ciclo, a.a. 2016/17, Piacenza, [http://hdl.handle.net/10280/53792].

Titolo: LIPOXYGENASE 4 CHARACTERIZATION AND CRISPR-CAS9 APPROACH TO ENHANCE FUSARIUM VERTICILLIOIDES (FV) RESISTANCE IN ZEA MAYS
Autore/i: BORRELLI, VIRGINIA MARIA GRAZIA
Tutor: MAROCCO, ADRIANO
LA NUBILE, ALESSANDRA
Coordinatore: TREVISAN, MARCO
Lingua: ENG
Abstract in italiano della tesi: Il Fusarium verticillioides (Fv) causa il marciume rosa della spiga e contamina le cariossidi con fumonisine, una famiglia di micotossine che colpisce mangimi e alimenti considerata cancerogena per l'uomo e gli animali. Sono stati condotti diversi studi per identificare i geni del mais associati alla resistenza della pianta ospite all'infezione da Fv e l'accumulo di fumonisina. È noto che le ossilipine regolano la difesa contro i patogeni e che il cross-talk lipidico ospite-patogeno influenza la patogenesi. A questo proposito, i mutanti di mais trasposonici del gene ZmLOX4, la linea suscettibile W22 e la resistente TZI18 sono stati testati per la resistenza a Fv mediante il saggio biologico Rolled Towel Assay (RTA). Inoltre, sono stati studiati i profili di espressione di 16 geni coinvolti nella via LOX e volatili verdi (GLV) e l'attività della lipossigenasi è stata analizzata nelle stesse linee. Inoltre, è stata applicata la tecnologia di modifica del genoma di Clustered Shortspeed Palindromic Repeat / Cas9 associato (CRISPR / Cas9) regolarmente esaminata per indagare le possibili implicazioni del gene ZmLOX6 e del fattore di trascrizione ZmWRKY125 nei meccanismi di resistenza contro Fv. L'espressione di questi geni è stata precedentemente osservata dagli esperimenti di RNA - Seq in genotipi resistenti al mais e Studi di Genome Wide Association (GWAS) che hanno portato a un SNP significativamente associato a ZmWRKY125. Inoltre, il gene ZmLOX4 è stato overespresso nella linea A188 per valutare un possibile miglioramento della resistenza alla malattia verso Fv. Il lavoro molecolare del CRISPR si basa su una doppia clonazione utilizzando due diverse single guide RNA (sgRNA) per un bersaglio genico. I costrutti sotto il promotore ZmpUBI nel vettore binario p1609 sono stati trasformati nella linea A188 utilizzando la trasformazione mediata da Agrobacterium tumefaciens. Le piante di mais modificate nei geni ZmLOX6 e ZmWRKY125 e ZmLOX4 che sovraesprimono saranno caratterizzate per RTA, prove sperimentali in campo e per il loro contenuto di fumonisina. Inoltre, saranno testati l’attività lipossigenasica totale, i suoi metaboliti derivati ​​e le osslipine, oltre all'analisi dell'espressione dei principali geni coinvolti nella via dell'acido jasmonico.
Abstract in inglese: Fusarium verticillioides (Fv) causes ear rot in maize and contaminates the kernels with fumonisins, a family of mycotoxins that affects feed and food and considered carcinogenic for humans and animals. Several studies were conducted to identify maize genes associated with host plant resistance to Fv infection and fumonisin accumulation. It is known that plant lipoxygenase (LOX)-derived oxylipins regulate defense against pathogens and that the host-pathogen lipid cross-talk influences the pathogenesis. In this regard, maize mutants carrying Mu insertions in the ZmLOX4 gene, the susceptible W22 and the resistant TZI18 lines were tested for Fv resistance by the screening method rolled towel assay (RTA). Additionally, the expression profiles of 16 genes involved in the LOX and green leaves volatiles (GLV) pathway were studied and the lipoxygenase activity was investigated in the same lines as well. Furthermore, the genome editing technology of Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat/associated Cas9 (CRISPR/Cas9) was applied in order to investigate the possible implication of the lipoxygenase gene ZmLOX6 and the transcription factor ZmWRKY125 in the resistance mechanisms against Fv. The enhanced expression of these genes was previously observed by RNA - Seq experiments in maize resistant genotypes and Genome Wide Association Studies (GWAS) resulted in one SNP significantly associated with ZmWRKY125. Moreover, the gene ZmLOX4 was over-expressed in the line A188 for evaluating a possible improvement of the disease resistance towards Fv. The CRISPR cloning was based on a double cloning using two different guides (sgRNA) for one gene target. The constructs under the maize promoter ZmpUBI in the binary vector p1609 were transformed into the maize A188 line using Agrobacterium tumefaciens mediated transformation. Maize plants edited in the genes ZmLOX6 and ZmWRKY125, and over-expressing ZmLOX4 will be characterized for Fv resistance using rolled towel assay, field assay and for their fumonisin content. Furthermore, the content of jasmonic acid, its derivative metabolites, and oxylipins will be tested, as well as the expression analysis of the main genes involved in the jasmonic acid pathway will be performed.
Data di discussione: 14-dic-2018
URI: http://hdl.handle.net/10280/53792
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FACOLTA' DI AGRARIA

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